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南京市交通系统现有团员2590名，分布在系统各企事业单位。
南京市交通局团委下属有长客总公司团委、市汽车运输公司团委、市联运公司团委、江海集团公司团委、交通工程总公司团委、金陵汽运公司团委、公路管理处团委、交通局运政稽查支队团委、大件公司团委、交通技工学校团委、长江南京航道局团委、长江南京航道工程局团委、三航三公司团委、金陵汽配团委、新华船厂团委等14个团委，下属中远航修、公路建设处2个团总支，公路运输管理处、航运管理处、汽车维修行业管理处、王家湾物流中心、交建集团、板桥汽渡、航道管理处、地方海事局等8个团支部。
局团委对这些基层单位的团组织的工作起组织指导作用，同时在青年文明号的创建上又对区县交通局的创建活动进行指导。（交通局机关团支部不归交通局团委领导，由机关团工委领导）
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